On peut remarquer les initiales sculptées dans la pierre "L" pour Louis XIV "M & T" pour Marie-Thérèse Bien qu'aucun souverain n'ait séjourné sur le phare de Cordouan.

Les deux vitraux, réalisés au moment de la construction de la chapelle, ont été restaurés récemment. Chaque année, des bénédictions nuptiales et des baptêmes y sont célébrés. Le premier sacrement du mariage inscrit sur le registre de Notre-Dame-de-Cordouan...

Au second étage, la chapelle, qui est la pièce la plus majestueuse du phare. Elle est surmontée d'une voûte percée de huit baies richement ornées et pavée du même marbre que l'appartement du Roi et que la Salle des Girondins.

Entre le cinquième et le sixième étage se trouve la chambre de quart, qui était autrefois garnie de deux lits avec alcôves pour l'usage des gardiens.